मणिपुर एवं नागालैण्ड सेक्टर की स्थापना दिनांक 01 मार्च, 1994 को परिचालनिक सेक्टर के तौर पर तथा वर्ष 2004 से प्रशासनिक सेक्टर के तौर पर हुई थी, तब से पुलिस महानिरीक्षक कार्यालय का संचालन ग्रुप केन्द्र, केरिपुबल लैंगजिंग, इम्फाल परिसर में हो रहा है । मणिपुर एवं नागालैण्ड सेक्टर की जिम्मेदारी मुख्य रूप से परिचालनिक क्षेत्र (मणिपुर एवं नागालैण्ड राज्य) तथा अन्य प्रशासनिक बटालियनों के कार्मिक की प्रशाशनिक दक्षता, प्रशिक्षण एवं उनके कल्याण संबंधी कार्यकलापों की देखरेख एवं उनका सुचारु रूप से संचालन करना है ।
यह सेक्टर मणिपुर एवं नागालैण्ड राज्यों में विभिन्न प्रकार की महत्वपूर्ण भूमिका का निर्वहन कर रहा है जिनमें से प्रमुखतः मणिपुर एवं नागालैण्ड राज्यों के राज्यपालों एवं नागालैण्ड राज्य के मुख्यमंत्री की सुरक्षा के अलावा मणिपुर राज्य में चल रहे एन.एफ. रेलवे परियोजना तथा अन्य महत्वपूर्ण संस्थानों को सुरक्षा प्रदान करना है । केन्द्रीय रिजर्व पुलिस बल मणिपुर एवं नागालैण्ड राज्यों की जीवन रेखा कही जाने वाली सामग्री जैसे- पैट्रोलियम पदार्थों, एल0पी0जी0 तथा अन्य महत्वपूर्ण सामग्रियों की आपूर्ति हेतु संचालित कॉनवाई को सुरक्षा प्रदान करता है । इसके अलावा मणिपुर एवं नागालैण्ड राज्यों में कानून-व्यवस्था की देखरेख भी केन्द्रीय रिजर्व पुलिस बल द्वारा की जाती है ।
मणिपुर एवं नागालैण्ड सेक्टर के गठन से लेकर अब तक इस सेक्टर का कार्यभार निम्नलिखित पुलिस महानिरीक्षकों द्वारा संभाला गया है :